Урупский район именовался ранее Преградненским[9] и был основан в составе Карачаевской автономной области 7 сентября 1938 года. 12 октября 1943 года, в связи с депортацией карачаевского народа, были упразднены Карачаевская автономная область и Преградненский район. Вновь район был образован в январе 1957 года.
Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 9 января 1957 года № 721/3 из Краснодарского края в район были переданы: село Псемён, хутор Ершов, посёлки Рожкао, Азиатский и Подскальный, а также ряд ныне не существующих посёлков (Верхний Бескес, Нижний Бескес, Мостовая Поляна, Тамский, Точёный)[10]. 15 января 1957 года к Преградненскому району были присоединены Исправненский, Преградненский и Сторожевский с/с бывшего областного подчинения.
Указ Президиума Верховного Совета РСФСР № 713/10 от 23 февраля 1960 года передал Курджиновский сельсовет Краснодарского края (в составе: посёлки Курджиново, Предгорный и Тёплый) также в состав Преградненского района Карачаево-Черкесской автономной области[10].
1 февраля 1963 года был образован Урупский промышленный район вместо существующего Преградненского района[11].
12 января 1965 года Президиум Верховного Совета РСФСР постановил[12]:
